API Documentation

This section provides detailed API documentation for all public functions and methods in Cell_BLAST.

• Module: Cell_BLAST.data
  • Dataset
  • annotation_confidence()
  • compute_libsize()
  • find_variable_genes()
  • map_vars()
  • normalize()
  • read_table()
  • select_vars()
  • write_table()
• Module: Cell_BLAST.directi
  • DIRECTi
  • align_DIRECTi()
  • fit_DIRECTi()
• Module: Cell_BLAST.latent
  • CatGau
  • Gau
  • Latent
  • Regularizer
  • SemiSupervisedCatGau
• Module: Cell_BLAST.prob
  • LN
  • MSE
  • NB
  • ProbModel
  • ZILN
  • ZINB
• Module: Cell_BLAST.rmbatch
  • AdaptiveMNNAdversarial
  • Adversarial
  • MNN
  • MNNAdversarial
  • RMBatch
• Module: Cell_BLAST.blast
  • BLAST
  • Hits
  • amd()
  • ed()
  • md()
  • npd_v1()
  • npd_v2()
  • sankey()